Le Conseil Régional est doté d'un Secrétariat Général dirigé par un Secrétaire Général.

Le Secrétariat Général est composé de trois directions :

• Direction des Opérations Financières et de la Réglementation (DOFR),

• Direction de l'Administration et de la Comptabilité (DAC),

• Direction du Contrôle et de la Surveillance du Marché (DCSM),

et d'un Contrôleur Interne.

Il comprend également un Service Juridique, un service du Patrimoine et du Budget et un Service Informatique.